{"id":1279,"date":"2018-09-19T08:34:29","date_gmt":"2018-09-19T06:34:29","guid":{"rendered":"https:\/\/www.norbol.org\/?p=1279"},"modified":"2018-09-19T08:34:29","modified_gmt":"2018-09-19T06:34:29","slug":"dna-strekkodekurs-ved-baikalsjoen","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/www.norbol.org\/index.php\/2018\/09\/19\/dna-strekkodekurs-ved-baikalsjoen\/","title":{"rendered":"DNA-strekkodekurs ved Baikalsj\u00f8en"},"content":{"rendered":"

\"lake-baikal\"<\/a>Baikalsj\u00f8en. Foto: T. Ekrem CC-BY 4.0.<\/em><\/p>\n

Deling av biodiversitetsdata er stadig viktigere for b\u00e5de forskning og forvaltning. Informasjon om arters forekomster, DNA-sekvenser og \u00f8kologi kan utnyttes i mye st\u00f8rre grad om den er lett tilgjengelig, men \u00e5 sette sammen og dele slik\u00a0informasjon fra ulike kilder er ikke alltid like lett. Dette var derfor tema for\u00a0ForBio (Forskerskolen i biosystematikk)<\/a> sitt kurs Data mobilization skills: training on mobilizing biodiversity data using GBIF and BOLD tools<\/em><\/a>, som ble avholdt i Naratey, p\u00e5 vestbredden av Baikalsj\u00f8en 14-20. september 2018.<\/p>\n

Sammen med \u00a0Siberian Institute of Plant Physiology and Biochemistry<\/a>\u00a0Russian Academy of Sciences (SIPPB SB RAS), Universitetet i Bergen (Universitetsmuseet<\/a>), ForBio<\/a>, og Global Biodiversity Information Facility (GBIF)<\/a>\u00a0bidro NorBOL i undervisningen av norske og russiske studenter i datamobilisering.\u00a0Kurset ble\u00a0finansiert av\u00a0Direktoratet for internasjonalisering og kvalitetsutvikling i h\u00f8yere utdanning<\/a>\u00a0(tidligere SIU, n\u00e5 DIKU), GBIF og ForBio.<\/p>\n

\"Group_photo-baikal\"<\/a>Studenter og undervisere p\u00e5 kurset ved Baikalsj\u00f8en. Foto: Dimitry Schigel CC-BY-SA 4.0.<\/em><\/p>\n

Seksten\u00a0entusiastiske og kunnskapsrike studenter har i l\u00f8pet av en uke deltatt p\u00e5 foredrag og praktiske \u00f8velser i 20 ulike moduler. Strekkode-biten av kurset inkluderte teori og praksis for b\u00e5de produsenter og brukere av DNA-strekkodedata. Det var fokus p\u00e5 bruk av BOLD, og studentene fikk pr\u00f8ve seg p\u00e5 ulike oppgaver med\u00a0datas\u00f8k, opplasting av metadata og sekvenser, samt bruke ulike analyseverkt\u00f8y. Dette var nytt stoff for de fleste, men de fant raskt l\u00f8sninger og\u00a0samarbeidet p\u00e5 imponerende vis.<\/p>\n

\"bold-practice\"<\/a>Entusiastiske\u00a0deltakere som jobber med\u00a0BOLD Systems. Foto T. Ekrem CC-BY 4.0.<\/em><\/p>\n

Videre ble det gitt en innf\u00f8ring i molekyl\u00e6rsystematikk og programvaren MEGA, og studentene brukte dette til \u00e5 dykke ned i litt mer avanserte metoder for analyse av\u00a0genetiske data. Hvordan kan man rekonstruere organismers slektskap? Hva er forskjellen mellom ulike m\u00e5ter \u00e5 konstruere slektskapstr\u00e6r\u00a0p\u00e5? Hvorfor trenger vi substitusjonsmodeller?<\/p>\n

Kurset avsluttet med studentenes presentasjoner av \u00abThe Baikal Biodiversity Challenge\u00bb. I denne oppgaven, som har l\u00f8pt som en r\u00f8d tr\u00e5d gjennom hele kurset,\u00a0skulle studentene designe et prosjekt for \u00e5 kartlegge mangfoldet\u00a0til\u00a0en gruppe organismer i omr\u00e5det rundt Baikalsj\u00f8en. For gj\u00f8re dette m\u00e5tte de sette seg inn i hvilke data som allerede foreligger og foresl\u00e5 l\u00f8sninger for \u00e5 fylle kunnskapshullene for regionen. Imponerende innsats og gode presentasjoner.<\/p>\n

Takk til alle arrang\u00f8rene, og BOLDs support team i Canada som var\u00a0til stor hjelp. Takk g\u00e5r naturligvis ogs\u00e5 til alle studenter og l\u00e6rere for\u00a0en flott og l\u00e6rerik uke!<\/p>\n

\"baikal-selfie-large\"<\/a>Happy barcoders med\u00a0#mydnabarcode skjerf. Foto: Laura Russell CC-BY-SA 4.0.<\/em><\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"

Baikalsj\u00f8en. Foto: T. Ekrem CC-BY 4.0. Deling av biodiversitetsdata er stadig viktigere for b\u00e5de forskning og forvaltning. Informasjon om arters forekomster, DNA-sekvenser og \u00f8kologi kan utnyttes i mye st\u00f8rre grad om den er lett tilgjengelig, men \u00e5 sette sammen og dele slik\u00a0informasjon fra ulike kilder er ikke alltid like lett. Dette var derfor tema for\u00a0ForBio […]<\/p>\n","protected":false},"author":7,"featured_media":0,"comment_status":"closed","ping_status":"closed","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"footnotes":""},"categories":[3,4,5],"tags":[],"class_list":["post-1279","post","type-post","status-publish","format-standard","hentry","category-aktuelt","category-kompetansebygging","category-undervisning"],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/www.norbol.org\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/1279","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/www.norbol.org\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/www.norbol.org\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.norbol.org\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/users\/7"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.norbol.org\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=1279"}],"version-history":[{"count":0,"href":"https:\/\/www.norbol.org\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/1279\/revisions"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/www.norbol.org\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=1279"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.norbol.org\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/categories?post=1279"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.norbol.org\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/tags?post=1279"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}