{"id":694,"date":"2015-01-16T15:05:52","date_gmt":"2015-01-16T15:05:52","guid":{"rendered":"https:\/\/www.norbol.org\/?p=694"},"modified":"2015-01-16T15:05:52","modified_gmt":"2015-01-16T15:05:52","slug":"workshop-i-dna-strekkoding-ved-universitetsmuseet-i-bergen-mars-2015","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/www.norbol.org\/index.php\/2015\/01\/16\/workshop-i-dna-strekkoding-ved-universitetsmuseet-i-bergen-mars-2015\/","title":{"rendered":"Workshop i DNA-strekkoding ved Universitetsmuseet i Bergen, mars 2015"},"content":{"rendered":"<p>P\u00e5 vegne av NorBol og Universitetsmuseet i Bergen, \u00f8nsker vi velkommen til workshop \u00a0i DNA-strekkoding for biomangfoldsstudier. Invitasjonen retter seg s\u00e6rlig mot nye bidragsytere til <a href=\"https:\/\/www.norbol.org\/\">NorBOL<\/a>s arbeid gjennom <a href=\"https:\/\/www.boldsystems.org\">BOLDSYSTEMS<\/a>, og m\u00e5let med workshopen er \u00e5 gi deltakerne en praktisk og teoretisk innf\u00f8ring i DNA-strekkoding gjennom dette systemet.<\/p>\n<p><b>Tid og sted<\/b><\/p>\n<p>Aktivitetene vil foreg\u00e5 i ved Naturhistorisk avdeling i <a href=\"https:\/\/www.uib.no\/eia\/77784\/realfagbygget\">Realfagbygget<\/a> i tiden 9.-11. mars 2015. Deltakerne m\u00e5 regne med lengre arbeidsdager enn normal arbeidstid.<\/p>\n<p><b>Innhold<\/b><\/p>\n<p>Deltakerne skal, i l\u00f8pet av workshopen, arbeide seg gjennom alle trinn i klargj\u00f8ringen av en full DNA-pr\u00f8veplate (95 pr\u00f8ver). Dette inneb\u00e6rer fotografering og dataregistrering av hver enkelt organismepr\u00f8ve, (vevs-)pr\u00f8vetaking, og\u00a0 innsending av pr\u00f8veplater og data til BOLD-systemet.<\/p>\n<p>Det forventes at deltakerne medbringer materiale av den flercellede organismegruppen de skal arbeide med (fortrinnsvis ca. 5 individer per antatt art fra norsk omr\u00e5de). Deltakere med nye prosjekttildelinger fra <a href=\"https:\/\/www.artsdatabanken.no\/\">Artsdatabanken,<\/a> og som enn\u00e5 ikke har egnet materiale, kan likevel delta ved \u00e5 samarbeide med andre deltakere som har materiale.<\/p>\n<p>I dette kurset vil vi ogs\u00e5 gi korte innf\u00f8ringsforedrag om teoretiske aspekter ved DNA-strekkoding og om relevante bioinformatiske analysemetoder, spesielt de som tilbys gjennom BOLD. \u00a0Vi vil kort redegj\u00f8re for betingelser som gjelder for NorBOL-finansierte sekvenseringsprosjekter. Vi vil ogs\u00e5 vise eksempler p\u00e5 ulike behov for systematisk og taksonomisk oppf\u00f8lging som strekkodedata kan synliggj\u00f8re n\u00e5r strekkoder er produsert.<\/p>\n<p><b>Instrukt\u00f8rer<\/b><\/p>\n<p><a href=\"https:\/\/www.uib.no\/personer\/Katrine.Kongshavn\">Katrine Kongshavn<\/a>, <a href=\"https:\/\/www.uib.no\/personer\/Endre.Willassen\">Endre Willassen<\/a>, Lena Ohnheiser m.fl.<\/p>\n<p><b>Finansiering<\/b><\/p>\n<p>Workshopen er finansiert av NorBOL og vil dekke reise p\u00e5 rimeligste m\u00e5te, overnatting p\u00e5 Steens Hotel og opphold for en person per p\u00e5g\u00e5ende prosjekt. Antall deltakere vil v\u00e6re begrenset til 10.<\/p>\n<p><b>P\u00e5melding <\/b><\/p>\n<p>gj\u00f8res per e-post til Katrine Kongshavn (Katrine.Kongshavn_at_um.uib.no) innen 09. februar. Innen 14. februar vil vi gi beskjed om hvorvidt du har f\u00e5tt plass p\u00e5 \u00e5rets workshop.<\/p>\n<p>P\u00e5meldingen m\u00e5 inneholde:<\/p>\n<ol>\n<li>Navn, adresse og kontaktinformasjon<\/li>\n<li>Om du har behov for overnatting<\/li>\n<li>Kort beskrivelse av hvilken organismegruppe du arbeider med og om eventuell finansiering fra Artsdatabanken eller andre kilder for videre arbeid. Hvilke og hvor mange pr\u00f8ver du tenker \u00e5 prosessere under workshopen, og hvilken type fotoutstyr du trenger for \u00e5 dokumentere dine \u00abvouchers\u00bb. Skriv ogs\u00e5 et par ord om eventuell tidligere erfaring med sekvensering \/ strekkoding.<\/li>\n<li>Hvilke tema du \u00f8nsker du eventuelt \u00e5 l\u00e6re mer om (flere valg mulig):<\/li>\n<\/ol>\n<ul>\n<li>Oppbygning av Barcode of Life Data Systems (BOLD, <a href=\"https:\/\/www.boldsystems.org\">www.boldsystems.org<\/a>) og hvordan starte et nytt prosjekt.<\/li>\n<li>Vevspr\u00f8vetaking, fylling av pr\u00f8veplater.<\/li>\n<li>Bildetaking og innsending av bilder til BOLD.<\/li>\n<li>Innsending av egenproduserte sekvenser og trace-files til BOLD.<\/li>\n<li>Analysering av sekvenser\/diversitet med verkt\u00f8y i BOLD.<\/li>\n<\/ul>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>P\u00e5 vegne av NorBol og Universitetsmuseet i Bergen, \u00f8nsker vi velkommen til workshop \u00a0i DNA-strekkoding for biomangfoldsstudier. Invitasjonen retter seg s\u00e6rlig mot nye bidragsytere til NorBOLs arbeid gjennom BOLDSYSTEMS, og m\u00e5let med workshopen er \u00e5 gi deltakerne en praktisk og teoretisk innf\u00f8ring i DNA-strekkoding gjennom dette systemet. Tid og sted Aktivitetene vil foreg\u00e5 i ved [&hellip;]<\/p>\n","protected":false},"author":7,"featured_media":0,"comment_status":"closed","ping_status":"closed","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"footnotes":""},"categories":[3,8,4],"tags":[],"class_list":["post-694","post","type-post","status-publish","format-standard","hentry","category-aktuelt","category-forskningsinfrastruktur","category-kompetansebygging"],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/www.norbol.org\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/694","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/www.norbol.org\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/www.norbol.org\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.norbol.org\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/users\/7"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.norbol.org\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=694"}],"version-history":[{"count":0,"href":"https:\/\/www.norbol.org\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/694\/revisions"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/www.norbol.org\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=694"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.norbol.org\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/categories?post=694"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.norbol.org\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/tags?post=694"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}