Prosjekter i Norge

Det er et stort antall forsknings- og inventeringsprosjekter som involverer DNA-strekkoding i Norge. I tillegg til prosjekter som bidrar til referansebiblioteket og NorBOLs arbeid, er det et økende antall anvendte prosjekter som benytter DNA-strekkoding i taksonomi, mattrygghet og miljøovervåkning, for eksempel Norsk insektovervåkning.

Koordineringen av arbeidet med referansebiblioteket er fordelt på disse institusjonene:

  • NTNU Vitenskapsmuseet: moser (Bryophyta), spretthaler (Collembola), døgnfluer (Ephemeroptera), steinfluer (Plecoptera), øyenstikkere (Odonata), vårfluer (Trichoptera), mudderfluer (Megaloptera), midd (Acari), tovinger (Diptera). Kontakt Aina Mærk Aspaas
  • Naturhistorisk museum, UiO: stilksporesopp (Basidiomycota), lav (Lichenes), mangeføttinger (Myriapoda), rettvinger (Orthoptera), plantesugere (Hemiptera), nettvinger (Neuroptera), skorpionfluer (Mecoptera), biller (Coleoptera), sommerfugler (Lepidoptera), veps (Hymenoptera), edderkopper (Araneae), vevkjerringer (Opiliones), krypdyr (Reptilia), amfibier (Amphibia), fugl (Aves), pattedyr (Mammalia), ferskvannsfisk (Pisces). Kontakt Gunnhild Marthinsen
  • Universitetsmuseet i Bergen, UiB: makroalger, svamper (Porifera), nesledyr (Cnidaria), leddormer (Annelida), bladføttinger (Branchiopoda), muslingkreps (Ostracoda), hoppekreps (Copepoda), fiskelus (Branchiura), rankeføttinger (Cirripedia), storkreps (Malacostraca), havedderkopper (Pycnogonida), mosdyr (Bryozoa), bløtdyr (Mollusca), armfotinger (Brachipoda), pigghuder (Echinodermata), kappedyr (Tunicata), marine fisk (Pisces). Kontakt Katrine Kongshavn
  • Tromsø Museum – Universitetsmuseet, UiT: karplanter (Tracheophyta), sekksporesopp (Ascomycota). Kontakt Marie Kristine Føreid)

En database over de artene som er strekkodet så langt finnes her: search.norbol.org.

DNA-strekkoding av materiale fra Artsprosjekter

Mange prosjekter finansiert av det norske Artsprosjektet har DNA-strekkoding som en sentral del av resultatoppnåelsen. NorBOL ønsker å bistå med rådgivning og teknisk assistanse til prøvetaking, fotografering og opplasting av data til BOLD. Dette kan for eksempel også innebære deltakelse på tokt og/eller assistanse med innlegging av sekvenser og kromatogramfiler i tilfeller der sekvensering gjøres i eget laboratorium. Aktiviteten foregår i utgangspunktet ved universitetsmuseene der det forventes at materialet deponeres, og som har lengst erfaring med DNA-strekkoding, men også andre NorBOL-institusjoner kan involveres. Kontaktperson er Torbjørn Ekrem.

DNA-strekkoding av marine invertebrater

Universitetsmuseet i Bergen har de senere årene satset aktivt på innsamling av materiale som kan strekkodes med DNA. Det foreliggende materialet er blant annet anskaffet gjennom omfattende inventeringer i Skagerrak, ved Mørekysten, og MAREANO-prosjektets innsamlinger i Nord-Norge. Innsamling og taksonomisk bearbeiding av mange marine organismegrupper er svært ressurskrevende, og dette hovedområdet vil dra nytte av de fordelene som ligger i å strekkode materiale som samles inn gjennom eksisterende prosjekter. Kontaktperson er Katrine Kongshavn.

DNA-strekkoding av terrestriske karplanter og sopp

Dette arbeidet har så langt vært fokusert på strekkoding av terrestriske karplantearter og sopp fra Troms og Finnmark oppbevart ved Tromsø museum og sopp og lav ved Naturhistorisk museum i Oslo. For karplanter er det brukt såkalt «genome skimming» for å generere referansebibliotek som består av hele kloroplast genom og ribosomal DNA. Vi vil dermed bli i stand til å studere for eksempel slektskap for alle plantearter, evolusjon av organeller, og utvikle strekkoder for spesielle plantegrupper eller urgammelt DNA. Kontaktperson er Inger Greve Alsos.

DNA-strekkoding av materiale i vitenskapelige samlinger

Objekter i vitenskapelige samlinger er svært verdifulle for DNA-strekkoding fordi de er kvalitetssikret med hensyn til identifikasjon og metadata. I tillegg kan samlinger inneholde arter som er sjeldne eller på annen måte vanskelig å få tak i i naturen. DNA-strekkoding av insekter på nål har vist seg å være en effektiv måte å generere mange strekkoder på kort tid, spesielt gjennom genome skimming. Kontaktperson er Torbjørn Ekrem.

Translate »