Category: Aktuelt

  • Nye COST nettverk tilknyttet DNA-strekkoding

    COST nettverket CA25120 «Advancing DNA BARcoding in Europe for Efficient, Sustainable and Inclusive BioDIVersity Monitoring (DNABARDIV)» fikk nylig innvilget støtte fra COST programmet. Dette prosjektet vil støtte den videre utviklingen av iBOL Europe. Fra Norge er Aino Hosia (UiB) og Torbjørn Ekrem (NTNU) blitt oppnevnt som medlemmer av Management Committee som møtes for første gang i Brüssel i September, 2026. Det er mange måter å engasjere seg i prosjektet og de ulike arbeidsgruppene på. Se lenken over for mer informasjon.

    COST nettverket CA25163 «Advancing the integration of environmental DNA based approaches into policy frameworks (eDNA4Policy)» fikk også innvilget støtte. Her er medlemmene av Management Committee ikke oppnevnt enda, men ta kontakt med Torbjørn for mer informasjon om du er interessert.

  • Kurs: DNA-strekkoding med Oxford Nanopore Technology

    I samarbeid med Biodiversity Genomics Europe Plus arrangerer forskerskolen BIOCORE kurs i bruk av ONT for DNA-strekkoding. Kurset finner sted ved NTNU i Trondheim, 21-24. september, 2026. For mer informasjon om kursinnhold og påmeldingsfrist, se kursets nettside her: Barcoding with ONT MinION: Theory and Practice

  • NorBOL workshop 10. februar

    NorBOL arrangerer online workshop for alle som er interessert i å lære mer om hvordan en sender inn prøver og legger inn bilder og metadata i Barcode of Life Data Systems. Vi vil også gå gjennom noen av analyseverktøyene som plattformen tilbyr. Workshopen arrangeres 10 februar på Zoom fra kl. 09:00 – 13:00. Et mer detaljert program vil være tilgjengelig i begynnelsen av februar. Ta kontakt med Aina Mærk Aspaas eller Torbjørn Ekrem om du ønsker å melde deg på.

  • Biodiversity Genomics Europe (BGE) tilbyr DNA-strekkoding og skimming av europeiske arter

    Et av målene i BGE er å fylle i referansebiblioteket for europeiske arter. Det er et spesielt fokus på pollinatorer, ferskvannsarter, marine arter og arter viktige for miljøovervåkning, men materiale fra alle flercellede organismer er aktuelt. Det er utarbeidet en liste over dyr som mangler strekkoder i BOLD her. Velg gruppen du ønsker informasjon om og vent til tabellen lastes (det kan ta litt tid). Innsending av prøver og metadata er veldig likt det vi har gjort i NorBOL de siste årene og alle kostnader til sekvensering blir dekket av prosjektet. NTNU Vitenskapsmuseet og NHM i Oslo er partnere i prosjektet og kan hjelpe til med fasilitering. Ta gjerne kontakt med Torbjørn Ekrem om du ønsker mer informasjon om hva dette går ut på og hvordan du kan bidra.

  • NorBOL 2 søknad innsendt til Forskningsrådet

    Sammen med partnere fra Naturhistorisk museum i Oslo, Norges arktiske universitetsmuseum i Tromsø, Universitetsmuseet i Bergen og Centre for Biodiversity Genomics ved University of Guelph, sendte NTNU Vitenskapsmuseet inn søknad til Forskningsrådets infrastrukturprogram 15. november. I søknaden argumenteres det blant annet for behovet om å fortsette arbeidet med referansebiblioteket over norske arter, utvikle naturbiobanker ved norske naturhistoriske samlinger, videreutvikle protokoller for isolering av DNA fra utfordrende prøver, og for behovet for genome skimming og referansegenomer over utvalgte arter. Svar ventes i midten av 2024 med eventuell oppstart i januar 2025.

  • Invitasjon til NorBOL-workshop 2023

    NorBOL inviterer til workshop i DNA-strekkoding 6-8. desember, 2023. Målet for workshopen er å gi deltakerne en praktisk og teoretisk innføring i DNA-strekkoding gjennom NorBOL og Barcode of Life Data Systems (BOLD). Vi satser på en fysisk workshop i år der deltakerne samles ved NTNU Vitenskapsmuseet. Alle er velkomne og NorBOL dekker reiseutgifter og overnatting til en deltaker per artsprosjekt i tillegg til lunsj og middag for alle deltakere.

    Tilreisende deltakere tar med eget materiale og jobber med dette under workshopen: fotografering, prøvetaking og utfylling av data-ark. Har man ikke eget materiale kan man jobbe med materiale fra museets samlinger. Vi går også gjennom de mest brukte analysefunksjonene i BOLD4, og man kan få hjelp til å analysere egne data, eller prøve seg på et eksempeldatasett. Følg lenken for nærmere informasjon om krav til medbrakt materiale; et tentativt program er gitt nedenfor.

    Påmelding gjøres til Aina Mærk Aspaas på e-post innen 1. november 2023.

    Påmeldingen må inneholde

    • navn, adresse og kontaktinformasjon
    • om du har behov for overnatting
    • eventuelle allergier eller diettkrav
    • kort beskrivelse av hvilken organismegruppe du jobber med
    • antall individer du planlegger å prosessere under workshopen (helst 95, og ikke flere)
    • omtrentlig størrelse på organismene – for at vi skal kunne vurdere type fotoutstyr

    Vi håper mange har mulighet til å delta!

    Hilsen Aina og Torbjørn

    Tentativt program

    Onsdag 6. desember

    11:00 Ankomst deltakere
    12:00 Lunsj
    13:00 Kahoot
    13:15 Generell innføring i DNA strekkoding, NorBOL og iBOL, Presentasjon av BOLD, Gjennomgang av alle sampling-stegene og utfylling av data-ark. Jobbe med eget materiale:
    – Last opp data til BOLD
    – Ta bilder og last opp til BOLD
    – Prøvetaking
    – Last opp sekvenser og trace-files
    19:00 Middag

    Torsdag 7. desember

    09:00 Jobbe med eget materiale
    12:00 Lunsj
    13:00 Jobbe med eget materiale
    16:00 Hva gjør du når resultatene kommer? Analytiske verktøy i BOLD
    18.30 Middag

    Fredag 8. desember

    09:00 Analyser i BOLD v4. Analyser egne data eller et eksempel-datasett evt. jobbe med eget materiale
    12:00 Lunsj

  • 2 millioner år gammelt DNA identifisert med referanser fra PhyloNorway

    Identifisering av tidligere tiders artsamfunn har nådd et nytt høydepunkt: 2 millioner år gammelt DNA fra Kap København på Grønland har avslørt et økosystem veldig forskjellig fra dagens arktiske miljø. Her levde blant annet mastodonter, tuja og gran sammen med reinsdyr og gjess. Studiet er publisert i det anerkjente tidsskriftet Nature og lot seg gjennomføre ved å bruke et referansebibliotek opparbeidet av PhyloNorway i samarbeid med NorBOL, der Norges arktiske universitetsmuseum med professor Inger Greve Alsos i spissen har vært helt sentrale. Les mer om funnene på forskning.no.

  • BIOSCAN NOReDNA Conference 2022

    NTNU Vitenskapsmuseet i samarbeid med Naturhistorisk museum (UiO), Norges arktiske universitetsmuseum (UiT) og Artsdatabanken inviterer til konferanse om miljø-DNA og DNA metastrekkoding 9-10 november, 2022. Konferansen holdes på Scandic Nidelven i Trondheim og har som mål å samle ekspertise fra inn- og utland til faglige diskusjoner rundt bruk av molekylære verktøy til kartlegging og overvåkning av biologisk mangfold. For mer informasjon om registrering, program og annet, se konferansens nettside: BIOSCAN NOReDNA 2022

  • Invitasjon til workshop i DNA-strekkoding 2021

    NorBOL inviterer til workshop i DNA-strekkoding 25.-26. november 2021. Målet for workshopen er å gi deltakerne en praktisk og teoretisk innføring i DNA-strekkoding gjennom NorBOL og Barcode of Life Data Systems (BOLD). Vi satser på en hybrid workshop i år der introduksjoner og foredrag skjer digitalt, mens opplæring i prøvetaking og fotografering skjer fysisk ved et av universitetsmuseene. Vi tar også imot tilreisende deltakere ved NTNU Vitenskapsmuseet og kan refundere reise- og overnattingsutgifter for deltakere i kartleggingsprosjekt finansiert av Artsprosjektet.

    Tilreisende deltakere tar med eget materiale og jobber med dette under workshopen: fotografering, prøvetaking og utfylling av data-ark. Har man ikke eget materiale kan man jobbe med materiale fra museets samlinger. Siste dagen går vi gjennom analysefunksjoner i BOLD4, og man kan få hjelp til å analysere egne data, eller prøve seg på et eksempeldatasett. Følg lenken for nærmere informasjon om krav til medbrakt materiale og tentativt program.

    Påmelding gjøres til Aina Mærk Aspaas på e-post innen 8. november 2021. Deltakere i Artsprosjekter har forrang og må melde seg på innen 1. november for ikke å komme på venteliste.

    Påmeldingen må inneholde

    • navn, adresse og kontaktinformasjon
    • om du har behov for overnatting
    • eventuelle allergier eller diettkrav
    • kort beskrivelse av hvilken organismegruppe du jobber med
    • antall individer du planlegger å prosessere under workshopen (helst 95, og ikke flere)
    • omtrentlig størrelse på organismene – for at vi skal kunne vurdere type fotoutstyr
    • tidligere erfaring med sekvensering/strekkoding
    • om du er interessert i analysefunksjonene i BOLD4

    Vi håper mange har mulighet til å delta!

    Hilsen Aina Mærk Aspaas og Torbjørn Ekrem

  • BIOSCAN Europe

    BIOSCAN Europe ble lansert i februar 2021 og vil bli det europeiske knutepunktet for samarbeid om bruk av DNA strekkoding og andre teknologiske verktøy i kartlegging og overvåkning av biologisk mangfold.

    Initiativet som ledes av Naturalis i Nederland er knyttet til iBOL og det internasjonale BIOSCAN som ble lansert i Trondheim, juni 2019. NorBOL er med som en av flere nasjonale nettverk og vil spille en aktiv rolle i etableringen av en europeisk node for BIOSCAN.

Translate »