Author: torbjoe

  • 6th International Barcode of Life Conference

    The sixth international conference on DNA Barcoding just recently ended with wise words from Thomas Lovejoy, Dan Janzen and Paul Hebert: The species on our globe are going extinct faster than ever before and we have an urgent need to retrieve more knowledge of our biodiversity before it is gone for good.

    The conference in Guelph, Canada was impressive in all sorts of ways and the scientific depth truly underlined the theme “Barcodes to biomes”. With more than 30 excellent invited speakers and 600 delegates from 60 countries, the meeting became an unparalleled academic success. Abstracts from all talks and posters have been peer-reviewed and published in the journal Genome.

    Rozanski HallAll oral presentations were held in the Rozanski Hall at the University of Guelph. Photo Torbjørn Ekrem (CC-BY).

    In addition to the academically strong profile, the organizers clearly had valued good social settings in the planning of the conference. Moreover, a few other special arrangements made this a memorable event: The group photo (or rather film) was shot with a drone, the conference had its own beer (that had been barcoded of course) and the talks of all invited speakers was streamed live on YouTube. Most impressive, however, was perhaps that the results from a bioblitz held in a nearby reserve the day before the conference were ready by the end of the meeting! The specimens have been barcoded and the results assembled in a paper with 120 authors already submitted to the Biodiversity Data Journal. If you think I am the only one that is impressed by the 6th International Barcode of Life Conference, check out tweets with the hashtag #dnabarcodes2015.

    The meeting decided to establish the International Society for the Barcode of Life (ISBOL) and an interrim board will be established to work out the guidelines and tasks for the society. Two important areas will be the development of new standards for DNA barcoding as technology advances and support the organization of international conferences.

    It will be difficult to exceed this year’s conference in scientific breadth and organization. Perhaps this was one the reasons why Prof. Michelle van der Bank from the University of Johannesburg suggested the Krüger National Park as venue for the next conference in 2017. A setting in one of the world’s most famous protected wildlife areas certainly should attract many participants!

    UoG GryphonThe University of Guelph gryphon bids #mydnabarcode farewell. Photo Torbjørn Ekrem (CC-BY).

  • 6th International Barcode of Life Conference

    Den sjette internasjonale konferansen på DNA-strekkoding ble nylig avsluttet med ord til ettertanke fra Thomas Lovejoy, Dan Janzen og Paul Hebert: Verdens artsmangfold forsvinner raskere enn noensinne og vi har et akutt behov for å tilegne oss mer kunnskap om klodens arter og deres biologi før de forsvinner for godt.

    Konferansen i Guelph, Canada var imponerende på alle måter og den faglige bredden og dybden understreket møtets tema “Barcodes to biomes” til fulle. Med hele 30 inviterte foredragsholdere i eliteklassen og 600 deltagere fra 60 land ble møtet en overveldende faglig suksess. Abstracts fra alle foredrag og postere er publisert i tidsskriftet Genome.

    Rozanski HallAlle foredrag ble holdt i Rozanski Hall ved Universitetet i Guelph. Foto Torbjørn Ekrem (CC-BY).

    I tillegg til en faglig meget sterk profil hadde arrangørene lagt vekt på sosiale sammenkomster og flere spesielle finurligheter. Hør bare: Gruppebildet ble tatt som film med drone, et eget øl ble brygget (og DNA-strekkodet) og alle inviterte foredrag ble streamet live på YouTube. I tillegg ble det holdt en bioblitz i et nærliggende naturreservat dagen før konferansen. De innsamlede organismene ble DNA-strekkodet og en artikkel med de 120 deltakerne som forfattere produsert i løpet av konferanseuken. Paperet er allerede under fagfellevurdering i tidsskriftet Biodiversity Data Journal. Ikke annet enn imponerende. – Og om du ikke tror det, se Twittermeldinger merket #dnabarcodes2015.

    På møtet ble det også besluttet å opprette en internasjonal forening for DNA-strekkoding (ISBOL) og et interrimstyre er nedsatt for å utarbeide rettningslinjer og oppgaver. Foreningen vil i stor grad ta over de oppgavene som CBOL har hatt tidligere, og med et demokratisk valgt styre blant annet avgjøre standarder for DNA-strekkoding og legge til rette for konferanser.

    Det blir ikke enkelt for kommende arrangører å overgå årets konferanse i faglig styrke og strømlinjeformet organisering. Kanskje var det derfor Michelle van der Bank fra Universitetet i Johannesburg foreslo Krüger National Park som møteplass for den neste konferansen i 2017. Med en setting i en av verdens mest berømte nasjonalparker vil nok mange bli fristet til å delta!

    UoG GryphonUniversitetet i Guelphs griff tar farvel med #mydnabarcode. Foto Torbjørn Ekrem (CC-BY).

  • New lichens for collections and DNA barcoding

    32 lichenologists from 12 European countries met in Steinkjer during the week 3-7 August 2015 for a field excursion and symposium. NorBOL was present and used the opportunity to sample tissue from almost 150 specimens for DNA barcoding, many of them from species of which participants had special competence. The meeting was arranged by the Nordic Lichen Society and was partly funded by the Norwegian Biodiversity Information Centre and NorBOL.

    Einar Timdal, Natural History Museum, UiO.

    Lav ved Mokk kobbergruveParticipants are sturying lichens at the old Mokk copper mine. Photo Mika Bendiksby (CC-BY).

    Juha Pykala & Mika BendiksbyJukka Pykälä and Mika Bendiksby sample lichens for DNA barcoding. Photo Einar Timdal (CC-BY).

  • Nye lav til samlinger og strekkoding

    32 lavforskere fra 12 europeiske land møttes i Steinkjer i uken 3-7 august 2015 for en feltekskursjon og et symposium. NorBOL var til stede og benyttet anledning til å ta nesten 150 prøver av lav for DNA strekkoding, mange av dem av arter som deltagere hadde spesiell kompetanse på. Møtet var arrangert av Nordisk lichenologisk forening og var delvis finansiert av Artsdatabanken og NorBOL.

    Einar Timdal, Naturhistorisk Museum, UiO.

    Lav ved Mokk kobbergruveDeltakere studerer lav ved Mokk kobbergruve. Foto Mika Bendiksby (CC-BY).

    Juha Pykala & Mika BendiksbyJukka Pykälä og Mika Bendiksby tar prøver til DNA-strekkoding. Foto Einar Timdal (CC-BY).

  • Miljøstrekkoding i ferskvann

    Er DNA strekkoding av vann og sparkeprøver bedre enn tradisjonelle metoder i miljøovervåkning av ferskvann? Dette er et av spørsmålene forskere ved NTNU Vitenskapsmuseet, BIO, NINA, NIVA og ZFMK ønsker å besvare i det nystartede prosjektet “Environmental barcoding av aquatic invertebrates (EBAI)”.

    Nylig ble det gjennomført feltarbeid i Rondane der både vann og bunndyr ble hentet ut av elven Døråla. Bunndyr ble lagt på sprit, mens vann ble filtrert gjennom ulike filtertyper.

    Kick samples VollenTerje Bongard (NINA) og Karstein Hårsaker (NTNU Vitenskapsmuseet) tar sparkeprøver ved Vollen. Foto: Torbjørn Ekrem (CC-BY).

    Postdoktor Markus Majaneva og prosjektleder Torbjørn Ekrem ved NTNU Vitenskapsmuseet rapporterer om svært vellykket feltarbeid der ikke engang kuling og regn kunne sette en stopper for filtrering av vannprøvene i det mobile laboratoriet (bagasjerommet på en bil). Resultatene fra det første eksperimentet er ventet sent i 2015 eller begynnelsen av 2016.

    FiltreringsoppsettFiltrering av vann. Foto Torbjørn Ekrem (CC-BY).

    Prosjektet er finansiert av Norges forskningsråd og Miljødirektoratet.

     

     

  • Environmental barcoding of aquatic invertebrates

    Is environmental DNA barcoding of water and benthos samples more effective than traditinonal methods in biological monitoring of freshwater ecosystems? This is one of the questions researchers at the NTNU University Museum, BIO, NINA, NIVA and ZFMK wish to answer in the project “Environmental barcoding av aquatic invertebrates (EBAI)”.

    A team from the project recently visited Rondane National Park where both water and benthic invertebrates were collected from the River Døråla. The invertebrates were fixed on ethanol while water was filtered through different filter types.

    Kick samples VollenTerje Bongard (NINA) and Karstein Hårsaker (NTNU University Museum) performing kick sampling at Vollen. Photo: Torbjørn Ekrem (CC-BY).

    Post doctor Markus Majaneva and PI Torbjørn Ekrem at the NTNU University Museum reports on a very successful fieldwork where not even strong winds and rain could stop filtering of the water samples in the mobile laboratory (in the back of a car). The first results from the experiments are expected towards the end of 2015 or the beginning of 2016.

    FiltreringsoppsettFiltering water. Photo Torbjørn Ekrem (CC-BY).

    The project is funded by the Research Council of Norway and the Norwegian Environment Agency.

     

  • DNA barcoding of Insects from the Swedish Malaise Trap Project

    Gunnhild Marthinsen (Natural History Museum Oslo) and Aina Mærk Aspaas (NTNU University Museum) visited Station Linné on Öland in June/July 2015 to sample insects from the Swedish Malaise Trap Project. As part of the collaboration  between NorBOL and the Swedish Barcode of Life Initiative (SweBOL), the two barcode managers wanted to sample Nordic insect species that had not already been barcoded from Norway.

    Aina-Aspaas-Oland-labAina Mærk Aspaas samples insect legs on Station Linné. Photo: Gunnhild Marthinsen.

    By the end of a short week, Aina and Gunnhild had sampled and photographed nearly 600 insects. The samples will be shipped to the Biodiversity Institute of Ontario for DNA analyses in August and results are expected later this autumn.

    Gunnhild-Marthinsen-Oland-lGunnhild Marthinsen photographs hymenoptera on Station Linné. Photo: Aina Mærk Aspaas.

    Thanks to Pelle Magnusson and Dave Karlsson for all help at the station!

  • DNA-strekkoding av insekter fra Svenska Malaisefälleprojektet

    Gunnhild Marthinsen (Naturhistorisk museum Oslo) og Aina Mærk Aspaas (NTNU Vitenskapsmuseet) dro i regi av NorBOL til Station Linné på Öland i juni/juli 2015 for å ta prøver av insekter fra det svenske malaisefelleprosjektet. Turen var en del av samarbeidet med det svenske initiativet på DNA-strekkoding (SweBOL) og hadde som mål å strekkode nordiske insektarter som ennå ikke er prøvetatt fra Norge.

    Aina-Aspaas-Oland-labAina Mærk Aspaas plukker insektbein på Station Linné. Foto: Gunnhild Marthinsen.

    I løpet av en knapp uke ble nærmere 600 insekter prøvetatt og fotografert. Prøvene vil bli sendt til DNA analyse hos Biodiversity Institute of Ontario i august og resultater forventes litt senere på høsten.

    Gunnhild-Marthinsen-Oland-lGunnhild Marthinsen fotograferer veps på Station Linné. Foto: Aina Mærk Aspaas.

    Stor takk til Pelle Magnusson og Dave Karlsson for hjelp med å legge forholdene til rette!

  • Fuglekrasj – barnearrangement ved Tromsø museum

    Hver søndag er det barnearrangement på Tromsø museum og søndag 10 mai var det DNA-strekkoding og fuglekrasj som sto på programmet. Selv om været var flott var det noen som tok turen innom museet og var med og lekte detektiv.

    strekkoder og seigmenn

    Historien bak er at en fugl har krasjet med et fly og alt som er igjen av fuglen er en fjær. Hvilken fugleart er det som har krasjet med flyet? Ut fra den fjæra som er igjen har vi funnet en DNA strekkode på 8 bokstaver, men vi vet ikke hvilken fugleart det er. Barna fikk i oppdrag å gå rundt i utstillingene for å finne ut hvilken fugl som hadde samme genetiske kode.

    Da rett fugleart ble funnet fikk de bygge den genetiske koden med seigmenn, og det går akkurat 8 seigmenn på en cocktail pinne (nam).

    Marie Kristine Føreid, Tromsø museum

  • Bird-strikes: DNA barcoding for children at Tromsø University Museum

    Tromsø Univeristy Museum has activities for children every Sunday. On Sunday May 10 this activity was on DNA barcoding and bird-strikes! Even though the weather was good outside, many children visited the museum to play detectives.

    strekkoder og seigmenn

    The background story is that a bird has struck an air-plane, but all that is left is this feather. Which bird species could it be? With a barcode string of letters from the feather, the children had to search the exhibition for a bird with matching DNA barcode. When found, they could build a barcode of “jelly-men”, each letter corresponding to a certain colour. Exactly 8 of them fit on the stick and made a great treat.

    Marie Kristine Føreid, Tromsø museum

Translate »